Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
CARTPTQ16568 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CARTPTQ16568 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms