Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms