Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CD300CQ08708 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms