Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms