Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms