Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CASP9P55211 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASP9P55211 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASP9P55211 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASP9P55211 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASP9P55211 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASP9P55211 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms