Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN5P54829 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN5P54829 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN5P54829 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN5P54829 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN5P54829 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN5P54829 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN5P54829 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN5P54829 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN5P54829 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN5P54829 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms