Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3M2P53677 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms