Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms