Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms