Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GCAP28676 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCAP28676 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCAP28676 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCAP28676 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCAP28676 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCAP28676 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCAP28676 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCAP28676 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCAP28676 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms