Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTAFRP25105 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms