Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAV1P15498 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms