Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEFHP12036 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEFHP12036 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEFHP12036 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEFHP12036 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEFHP12036 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEFHP12036 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms