Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F9P00740 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F9P00740 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F9P00740 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms