Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SEC24AO95486 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC24AO95486 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC24AO95486 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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