Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPBO95292 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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