Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP2O75323 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms