Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PPFIA3O75145 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms