Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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