Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms