Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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AP4B1Q9Y6B7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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AP4B1Q9Y6B7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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AP4B1Q9Y6B7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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AP4B1Q9Y6B7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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AP4B1Q9Y6B7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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AP4B1Q9Y6B7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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AP4B1Q9Y6B7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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AP4B1Q9Y6B7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AP4B1Q9Y6B7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP4B1Q9Y6B7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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