Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHKBQ9Y259 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms