Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms