Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HMG20BQ9P0W2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMG20BQ9P0W2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms