Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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