Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms