Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms