Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms