Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NAP1L3Q99457 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms