Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT140Q96RY7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT140Q96RY7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms