Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms