Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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