Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms