Protein–RNA interactions for Protein: Q7L804

RAB11FIP2, Rab11 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP2Q7L804 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB11FIP2Q7L804 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP2Q7L804 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms