Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms