Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ANKRD55Q3KP44 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms