Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms