Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIF1AQ16665 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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