Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC3Q15034 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms