Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
UBE2V1Q13404 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms