Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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