Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms