Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms