Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms