Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE3AQ05086 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms