Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms