Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms