Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V0D1P61421 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V0D1P61421 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V0D1P61421 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V0D1P61421 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms