Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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